Cartes peptidiques

Cartes peptidiques

Les solutions de Waters pour l’établissement de cartes peptidiques permettent d’obtenir des informations inégalées sur l’identification, la stabilité et les modifications des protéines. Adaptées aux applications, les solutions système de Waters intègrent la préparation des échantillons, les colonnes, l’automatisation, l’instrumentation et les logiciels ainsi que la méthodologie, la facilité d’utilisation, la documentation et le support applicatif. Elles améliorent la résolution des digestions complexes de protéines et de glycoprotéines avec une cadence d’analyse plus élevée.

Les solutions de Waters pour l’établissement de cartes peptidiques permettent d’obtenir des informations inégalées sur l’identification, la stabilité et les modifications des protéines. Adaptées aux applications, les solutions système de Waters intègrent la préparation des échantillons, les colonnes, l’automatisation, l’instrumentation et les logiciels ainsi que la méthodologie, la facilité d’utilisation, la documentation et le support applicatif. Elles améliorent la résolution des digestions complexes de protéines et de glycoprotéines avec une cadence d’analyse plus élevée.

Structure moléculaire du peptide en bleu
Peptide molecular structure in blue

Présentation

Les cartes peptidiques sont essentielles pour la caractérisation et le suivi complets des produits biopharmaceutiques. L’obtention d’une résolution chromatographique adéquate pour séparer de manière fiable chaque fragment de digestion nécessite des méthodes robustes et reproductibles dotées de performances chromatographiques exceptionnelles.

Les solutions de Waters pour l’établissement de cartes peptidiques associent automatisation, préparation des échantillons, séparation chromatographique, spectrométrie de masse et workflows logiciels globaux pour offrir une analyse inégalée des digestions complexes de protéines et de glycoprotéines avec une cadence élevée. Les solutions d’analyse qualitative et quantitative de Waters permettent une caractérisation efficace, un transfert de méthode simple et un contrôle de conformité pour les laboratoires de routine. Atteignez vos objectifs de recherche et développement grâce aux workflows robustes de Waters pour l’établissement de cartes peptidiques.


Applications

La caractérisation des cartes peptidiques est essentielle pour élucider la structure des acides aminés primaires et les attributs de qualité des protéines, y compris les anticorps monoclonaux (mAb) et les anticorps conjugués (ADC).

Après la digestion des protéines, chaque peptide suivant fournit des informations sur la séquence, le temps de rétention et l’intensité pour confirmer la séquence de la protéine entière. Waters fournit des workflows logiciels et du matériel de spectrométrie de masse puissant permettant de comprendre les mélanges de digestion complexes et de développer des méthodologies pouvant être transférées aux laboratoires de routine.

La caractérisation des cartes peptidiques est essentielle pour élucider la structure des acides aminés primaires et les attributs de qualité des protéines, y compris les anticorps monoclonaux (mAb) et les anticorps conjugués (ADC).

Après la digestion des protéines, chaque peptide suivant fournit des informations sur la séquence, le temps de rétention et l’intensité pour confirmer la séquence de la protéine entière. Waters fournit des workflows logiciels et du matériel de spectrométrie de masse puissant permettant de comprendre les mélanges de digestion complexes et de développer des méthodologies pouvant être transférées aux laboratoires de routine.



Notes d’application

Notes d’application

Le suivi d’attributs de peptides par LC/MS joue un rôle essentiel pour garantir la qualité et la sécurité des produits biothérapeutiques, étant donné que les organismes de réglementation exigent la confirmation de la structure souhaitée du produit pour démontrer la compréhension du procédé, au cours du développement et à des fins de libération des lots.

Son adoption s’étend à des domaines tels que les méthodes multiattributs (MAM), qui permettent de contrôler plusieurs attributs de qualité du produit (PQA) et attributs de qualité critiques (CQA) dans le cadre d’une seule analyse. Il permet également de détecter des impuretés et des modifications inconnues telles que l’oxydation, la désamidation, la modification par succinimide, la glycosylation, les modifications C- et N-terminales et l’isomérisation.

Le suivi d’attributs de peptides par LC/MS joue un rôle essentiel pour garantir la qualité et la sécurité des produits biothérapeutiques, étant donné que les organismes de réglementation exigent la confirmation de la structure souhaitée du produit pour démontrer la compréhension du procédé, au cours du développement et à des fins de libération des lots.

Son adoption s’étend à des domaines tels que les méthodes multiattributs (MAM), qui permettent de contrôler plusieurs attributs de qualité du produit (PQA) et attributs de qualité critiques (CQA) dans le cadre d’une seule analyse. Il permet également de détecter des impuretés et des modifications inconnues telles que l’oxydation, la désamidation, la modification par succinimide, la glycosylation, les modifications C- et N-terminales et l’isomérisation.



Notes d’application

Notes d’application

La détection optique, par exemple les UV, est souvent utilisée pour contrôler les peptides. Cette approche est considérée comme LA référence pour les tests d’identité et de qualité dans les environnements d’assurance et de contrôle qualité. Les peptides peuvent être contrôlés sur la base de leur profil, de leur abondance et de leur temps de rétention, ce qui peut révéler des CQA.

Les méthodes analytiques reproductibles et robustes nécessitent une validation approfondie, laquelle permet d’obtenir une méthodologie fournissant des informations essentielles sur les protéines biothérapeutiques, ce qui facilite leur caractérisation et l’évaluation de leur qualité.

La détection optique, par exemple les UV, est souvent utilisée pour contrôler les peptides. Cette approche est considérée comme LA référence pour les tests d’identité et de qualité dans les environnements d’assurance et de contrôle qualité. Les peptides peuvent être contrôlés sur la base de leur profil, de leur abondance et de leur temps de rétention, ce qui peut révéler des CQA.

Les méthodes analytiques reproductibles et robustes nécessitent une validation approfondie, laquelle permet d’obtenir une méthodologie fournissant des informations essentielles sur les protéines biothérapeutiques, ce qui facilite leur caractérisation et l’évaluation de leur qualité.



Notes d’application

Notes d’application


eBook : cartes peptidiques pour les produits biothérapeutiques

Les cartes peptidiques demeurent l’un des tests les plus importants et les plus riches en données pour la caractérisation et le suivi des produits biopharmaceutiques. Les solutions proposées dans cet eBook, de la préparation des échantillons à l’identification de masse en passant par l’automatisation et la séparation chromatographique, fournissent aux scientifiques des stratégies afin d’améliorer et de simplifier la tâche complexe qu’est l’établissement de cartes peptidiques. Par exemple, l’innovation dans les digestions tryptiques obtenue avec RapiZyme, une trypsine recombinante à méthylation homogène, permet d’atteindre une vitesse accrue, une fidélité de la digestion et de faibles concentrations de peptides dérivés de la trypsine grâce à sa résistance à l’autolyse, à sa pureté et à sa haute activité. Elle permet ainsi d’obtenir des cartes peptidiques plus fiables et plus reproductibles.

Les cartes peptidiques demeurent l’un des tests les plus importants et les plus riches en données pour la caractérisation et le suivi des produits biopharmaceutiques. Les solutions proposées dans cet eBook, de la préparation des échantillons à l’identification de masse en passant par l’automatisation et la séparation chromatographique, fournissent aux scientifiques des stratégies afin d’améliorer et de simplifier la tâche complexe qu’est l’établissement de cartes peptidiques. Par exemple, l’innovation dans les digestions tryptiques obtenue avec RapiZyme, une trypsine recombinante à méthylation homogène, permet d’atteindre une vitesse accrue, une fidélité de la digestion et de faibles concentrations de peptides dérivés de la trypsine grâce à sa résistance à l’autolyse, à sa pureté et à sa haute activité. Elle permet ainsi d’obtenir des cartes peptidiques plus fiables et plus reproductibles.


Solutions


Les systèmes LC et LC/MS de Waters offrent des performances de séparation et une sensibilité de pointe pour l’analyse des cartes peptidiques.

Les systèmes LC et LC/MS de Waters offrent des performances de séparation et une sensibilité de pointe pour l’analyse des cartes peptidiques.

Caractérisation et suivi efficaces des peptides tout au long du cycle de vie du produit

Caractérisation et suivi efficaces des peptides tout au long du cycle de vie du produit

Réalisez des analyses biopharmaceutiques par LC/MS dans chaque laboratoire GxP avec le système LC/MS BioAccord de Waters, qui comprend un spectromètre de masse haute résolution et un logiciel waters_connect pour analyser des données et créer des rapports conformément aux exigences réglementaires.

  • Peptide Map Characterization
  • Peptide Multi Attribute Monitoring

Instrument haute résolution complet pour une caractérisation et un transfert de méthode fiables

Instrument haute résolution complet pour une caractérisation et un transfert de méthode fiables

Accélérez la caractérisation et le suivi multiattributs avec le spectromètre de masse haute résolution Xevo G3 Q-Tof, un système de paillasse haute performance qui fournit des résultats qualitatifs et quantitatifs exacts.

  • Peptide Map Characterization
  • Peptide Multi Attribute Monitoring

Adsorption ultra-faible pour une sensibilité et une reproductibilité maximales

Adsorption ultra-faible pour une sensibilité et une reproductibilité maximales

Avec les colonnes et systèmes MaxPeak Premier, ne craignez plus les pertes d’analytes en raison d’interactions métalliques, qui peuvent être particulièrement accentuées sur des molécules biologiques.

  • Peptide Map Characterization
  • Peptide Multi Attribute Monitoring
  • Peptide Mapping with Optical Detection

Logiciel d’applications utilisable en réseau et conforme aux exigences réglementaires pour simplifier l’acquisition des données LC/MS, leur traitement et la création des rapports.

Logiciel d’applications utilisable en réseau et conforme aux exigences réglementaires pour simplifier l’acquisition des données LC/MS, leur traitement et la création des rapports.

Analyse et traitement des données simplifiés

Analyse et traitement des données simplifiés

Accélérez le processus de l’analyse de l’échantillon à la prise de décision avec waters_connect pour produits biopharmaceutiques, qui comprend des applications et workflows dédiés à l’analyse MAM, à l’analyse en masse intacte, à la confirmation de séquence et bien plus encore.

  • Peptide MAM
  • Intact and Subunit MAM
  • Peptide Multi Attribute Monitoring

Simplification de l’acquisition des données, de leur traitement et de leur communication

Simplification de l’acquisition des données, de leur traitement et de leur communication

Équipez votre laboratoire du système de données chromatographiques (CDS) Empower et bénéficiez de fonctions avancées de gestion des données de laboratoire pour les analyses d’impuretés, y compris l’acquisition, le traitement et la communication des données pour les instruments de chromatographie en phase liquide.

  • Peptide Mapping with Optical Detection

Colonnes et consommables offrant des performances de pointe en LC et LC/MS pour les cartes peptidiques.

Colonnes et consommables offrant des performances de pointe en LC et LC/MS pour les cartes peptidiques.

Optimisation de la sensibilité tout en limitant l’adsorption des peptides désamidés acides sur les surfaces métalliques

Optimisation de la sensibilité tout en limitant l’adsorption des peptides désamidés acides sur les surfaces métalliques

Bénéficiez d’un rendement et d’une sensibilité accrus pour les peptides acides grâce aux colonnes à peptides ACQUITY, XSelect et XBridge Premier de Waters. Soumises à un contrôle qualité par lots avec l’étalon de digestion du cytochrome c de Waters, ces colonnes offrent des performances constantes d’une colonne à l’autre. 

  • Reversed-Phase Peptide Columns
  • Peptide Mapping
  • Protein Digestion
  • Tryptic Digestion

Bénéficiez de digestions rapides, propres et complètes des protéines

Bénéficiez de digestions rapides, propres et complètes des protéines

Réalisez des digestions mAb rapides, propres et complètes en seulement 30 minutes avec la trypsine RapiZyme de qualité MS. Cette enzyme hautement active et résistante à l’autolyse réduit les risques de modifications artificielles lors de la préparation de l’échantillon avant l’analyse LC/MS.

  • Tryptic Digestion
  • Protein Digestion
  • Peptide Mapping

Optimisez la préparation des échantillons pour l’établissement de cartes peptidiques

Optimisez la préparation des échantillons pour l’établissement de cartes peptidiques

Obtenez des cartes peptidiques reproductibles et de grande qualité en moins de 2 heures et demie grâce aux kits de digestion tryptique de protéines PeptideWorks adaptés aux procédures manuelles ou automatisées. Ces kits se révèlent 4 fois plus rapides que les méthodes classiques et permettent de réduire de 78 % le nombre de clivages manqués.

  • Tryptic Digestion
  • Protein Digestion
  • Peptide Mapping

Créez un point de référence des performances de vos colonnes pour peptides et validez-les en toute simplicité

Créez un point de référence des performances de vos colonnes pour peptides et validez-les en toute simplicité

Vérifiez les performances des colonnes et surveillez leur état tout au long de leur durée de vie grâce aux étalons pour peptides de Waters. Effectuez des séparations de peptides sur n’importe quel système UPLC, HPLC ou LC/MS en utilisant des étalons préconditionnés spécialement formulés pour minimiser les pertes d’échantillons et les écarts.

  • Peptide Standards
  • Peptide Mapping
  • Protein Digestion
  • Tryptic Digestion

Gagnez en efficacité et en temps grâce à des solutions d’automatisation de laboratoire vérifiées.

Gagnez en efficacité et en temps grâce à des solutions d’automatisation de laboratoire vérifiées.

Amélioration de l’efficacité et du rendement de la préparation des échantillons

Amélioration de l’efficacité et du rendement de la préparation des échantillons

Rationalisez votre protocole de préparation d’échantillons pour les analyses LC/MS grâce à la gamme d’automatisation et d’équipement de laboratoire de Waters, qui propose des workflows vérifiés permettant de minimiser la variabilité, d’améliorer la traçabilité et de simplifier le transfert de méthodes.

  • Peptide Map Characterization
  • Peptide Multi Attribute Monitoring
  • Peptide Mapping with Optical Detection

La réussite à portée de clic

La réussite à portée de clic

Optimisez la productivité et le succès de votre laboratoire avec Waters Global Services, pour maintenir une performance optimale des systèmes, minimiser les temps d’immobilisation, prendre en charge les applications les plus complexes et répondre aux strictes exigences de conformité.

  • Peptide Map Characterization
  • Peptide Multi Attribute Monitoring
  • Peptide Mapping with Optical Detection

Rendez la science plus accessible grâce à Waters Capital

Rendez la science plus accessible grâce à Waters Capital

Maximisez les ressources et minimisez les risques grâce aux options de paiement proposées par Waters Capital, notamment la mise à niveau des équipements vieillissants, une assistance personnalisée et le regroupement de l’ensemble de vos services en un seul forfait mensuel.

  • Peptide Map Characterization
  • Peptide Multi Attribute Monitoring
  • Peptide Mapping with Optical Detection

Les données parlent d’elles-mêmes

Les données parlent d’elles-mêmes
Comparaison des surfaces (%) du système ACQUITY UPLC I-Class PLUS et du système ACQUITY UPLC H-Class PLUS Bio (avec mélangeur de 340 µL et retard du gradient ) sur quatre injections. Les données indiquent que la surface des pics est conservée entre les systèmes.
Le workflow d’établissement de cartes peptidiques du système BioAccord permet d’identifier les PTM. La figure présente le volet de révision après le traitement automatisé des données. Le tableau des composants contient les éléments suivants : informations sur la séquence, masse m/z et masse neutre, tolérance de masse, abondance rel. en %, ainsi que des informations sur la fragmentation pour chaque peptide. Le tableau récapitulatif fournit une vue concise des modifications peptidiques sélectionnées dans tous les échantillons. La cohérence des temps de rétention est illustrée dans le volet inférieur gauche à l’aide du TIC pour les injections 1 et 25.
Superposition IC d’injections d’étalon de digestion tryptique d’anticorps monoclonaux avec IDC désactivé et IDC activé avec des seuils de 5, 10 et 20. Le tableau correspondant présente la taille totale du fichier, le pourcentage de réduction et le temps de traitement des données avec le système d’information scientifique UNIFI.
Profils XIC démontrant l’effet de la chimie de surface des particules (BEH et silice) sur les sélectivités pour une sélection de peptides tryptiques de mAb NIST en utilisant du TFA à 0,1 % dans des phases mobiles eau/acétonitrile. Les chromatogrammes ont été alignés en fonction du temps de rétention du H38. Les valeurs de MM et de pI pour les peptides (Da) sont indiquées dans l’encadré du tableau. Les identités des pics sont présentées dans le tableau 3.
Abondance relative des clivages manqués et non spécifiques pour des digestions de mAb NIST préparées en utilisant des protocoles PeptideWorks manuel et automatique et avec un kit populaire de trypsine immobilisé. Les barres d’erreur représentent un écart-type. PeptideWorks permet d’obtenir une digestion plus complète et plus spécifique.
Digestions avec rapport enzyme:protéine à 1:5 de Remicade, mettant en évidence la propreté de la ligne de base avec la trypsine RapiZyme (en bleu) par rapport à un produit concurrent phare (en noir). L’axe Y représente l’intensité du TIC en %.

Webinaires et ressources


Méthode peptidique multiattributs, ou MAM, sur le système LC/MS BioAccord avec technologie SmartMS
Méthode peptidique multiattributs, ou MAM, sur le système LC/MS BioAccord avec technologie SmartMS

  • eBook

Cartes peptidiques pour les produits biothérapeutiques

Cartes peptidiques pour les produits biothérapeutiques
  • Infographie

Une digestion de protéines plus intelligente

Une digestion de protéines plus intelligente
  • Infographie

RapiZyme : des résultats rapides, nets et complets

RapiZyme : des résultats rapides, nets et complets
  • Infographie

RapiZyme : flexibilité d’utilisation

RapiZyme : flexibilité d’utilisation
  • Poster

Amélioration des workflows d’établissement de cartes peptidiques biopharmaceutiques grâce à une nouvelle enzyme, la trypsine, résistante à l’autolyse

Amélioration des workflows d’établissement de cartes peptidiques biopharmaceutiques grâce à une nouvelle enzyme, la trypsine, résistante à l’autolyse
  • Support Articles

Nouvelle méthode automatisée de préparation d’échantillons pour les cartes peptidiques

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Documents associés

Obtenez plus d’informations de vos bioanalyses de produits biothérapeutiques et vaccinaux grâce aux workflows complets de LC/MS et MS de Waters pour la caractérisation et le suivi en routine par méthode multiattributs (MAM).

Garantissez le respect des normes de qualité et de développement des médicaments grâce aux solutions de pointe de Waters pour la purification, la caractérisation et le suivi en laboratoire de peptides synthétiques tels que le GLP-1 (glucagon-like peptide 1).

Évaluez l’identité, les glycoformes et les modifications des protéines avec les techniques de spectrométrie de masse pour l’analyse en masse intacte et en sous-unités intégrées dans les solutions de Waters. Vous pourrez ainsi comprendre les structures des protéines et faire avancer la recherche dans le domaine biopharmaceutique.

Découvrez-en davantage sur les solutions de cartes peptidiques.

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Structure moléculaire du peptide en bleu
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