探索的プロテオミクスは、これらの複雑な高分子が果たしている重要な機能的役割を科学者が理解するのに役立ちます。疾患状態で発現に差を示すタンパク質を正確に同定することにより、機能的バイオマーカーに橋渡しできる可能性があります。プロテオミクスは、システム生物学のアプローチの重要な構成要素でもあり、マルチオミクス分析は、結果をバリデーションして、代謝およびシグナル伝達のプロセスの理解をより深めるのに役立ちます。
ウォーターズは、プロテオームをより正確に理解するために、検出可能なすべての分子種についてペプチドフラグメントスペクトルを生成するとともに、「ボトムアップ」の非標識プロテオミクスメソッドの定量分析を改善するための、データインディペンデント取得（DIA）戦略を開発しました。ウォーターズの高分解能質量分析テクノロジー、ピークキャパシティーが高いクロマトグラフィーシステム、Progenesis ソフトウェア、DIA メソッドを使用することで、プロテオームをさらに深堀りして調べることができます。
ホワイトペーパー：プロテオミクストラップ溶出ナノクロマトグラフィー用の最適な固定相の選択に関する検討事項
ウォーターズの LC-MS システムは、探索的プロテオミクスワークフローにおいて究極の分離能と感度を提供します。
新規サイクリックイオンモビリティー分離と最先端の高性能飛行時間型質量分析を組み合わせた SELECT SERIES Cyclic IMS により、ルーチンイオンモビリティーのメリットが拡張し、さまざまな高分離能分離が実現します。
SYNAPT XS は、複雑な混合物を調査するための SONAR や HDMSE により最先端の分析性能を提供し、探索メタボロミクスアプリケーションにおける科学的創造性と技術的成功をサポートする究極の柔軟性が得られます。
ラボに ACQUITY UPLC M-Class システムを導入して、UPLC テクノロジーを使用することで、マイクロフローやナノフローの液体クロマトグラフィーの感度が実現し、分析スケールの UPLC システムが使いやすくなります。
2D テクノロジー搭載 ACQUITY UPLC M-Class システムを使用することで、2D-LC 分離プロセスが合理化し、メ非常に直観的なメニュー方式のメソッドのセットアップ、標準化された分離ケミストリー、複雑なプロテオミクスサンプルのクロマトグラフィー分離が向上するインテリジェントなバルブ操作が可能になります。
ハイスループットプロテオミクスデータの多変量統計解析。教師なし主成分分析（A）では、健常対照と乳がんの被験者が明確に分離していることがわかります。対応するヒートマップ（B）では、2 つのコホート間でタンパク質発現に差がある明確な領域が浮き彫りになっています。ApoA2 および LRG1 のそれぞれ発現低下と発現上昇を例（C）として示しています。箱ひげ図により、大きな差があること、および各グループ内ではデータがしっかり保存されていることがわかります。
m/z スケールでは重複しているが、異なるチャージ状態（1+ および 2+）を示すフラグメントイオンを、IMS で分離することができます。図からわかるように、1 価イオンの方が WE なしスペクトルではるかに小さくなっています。WE を使用すると、異なるチャージ状態のイオンを抽出して干渉を効果的に除去することができ、後続のデータベース検索での同定がより確実になります。
12 種の E. Coli タンパク質のシーケンスカバー率の再現性。5% CV がルーチンに見られます。
3 つのコホートにおけるタンパク質の概要。ベン図から、大半のタンパク質が条件間で重複していることがわかり（A）、箱ひげ図から、SONAR 手法の %CV（B）およびタンパク質のシーケンスカバー率（C）に関する技術的再現性がわかります。
