Consumibles y columnas de purificación de oligonucleótidos

Consumibles y columnas de purificación de oligonucleótidos

Descubra cómo las columnas de preparación y los consumibles para oligonucleótidos a escala de laboratorio de Waters pueden ayudar a lograr rápidamente purificaciones excepcionales de alta recuperación y alto rendimiento con escalado vertical directo. Cada lote de sorbente, creado con una tolerancia al pH y a la temperatura líder en el sector, se somete a pruebas de QC y se selecciona utilizando patrones de oligonucleótidos de Waters para garantizar el rendimiento y la reproducibilidad entre lotes.

Descubra cómo las columnas de preparación y los consumibles para oligonucleótidos a escala de laboratorio de Waters pueden ayudar a lograr rápidamente purificaciones excepcionales de alta recuperación y alto rendimiento con escalado vertical directo. Cada lote de sorbente, creado con una tolerancia al pH y a la temperatura líder en el sector, se somete a pruebas de QC y se selecciona utilizando patrones de oligonucleótidos de Waters para garantizar el rendimiento y la reproducibilidad entre lotes.

Learn how to achieve high performance oligonucleotide preparative chromatography by utilizing XBridge Oligonucleotide OBD Prep Columns and efficient method optimization considerations
Los flujos de trabajo analíticos robustos y prácticos de Waters para la caracterización y la monitorización de oligonucleótidos sintéticos garantizan la comprensión del proceso y la calidad del producto.

Descripción general

La purificación de un producto de oligonucleótido de longitud completa a partir de las impurezas generadas durante la síntesis es esencial para garantizar su funcionalidad, seguridad y eficacia en aplicaciones farmacéuticas y de diagnóstico. Debido a su naturaleza polianiónica, la purificación de oligonucleótidos con alta selectividad y resolución es un desafío. La cromatografía de fase reversa con par iónico (IP-RP) se ha convertido en la técnica dominante y preferida.

Las columnas probadas por lotes y estables a pH/temperatura elevados con niveles controlados de interacciones secundarias ayudan a eliminar rápidamente los cuellos de botella que consumen mucho tiempo. Las columnas de densidad de lecho óptima (OBD) BEH C18 para oligonucleótidos XBridge de Waters son la opción preferida para las columnas de preparación, ya que ofrecen un rendimiento garantizado, una escalabilidad constante y una purificación de alta recuperación de varios oligonucleótidos con modificaciones químicas complejas.

  • Las partículas BEH C18 de oligonucleótidos probadas por lotes y con certificado de control de calidad (QC) proporcionan un escalado vertical predecible y una purificación uniforme en una variedad de diámetros de columna.
  • La tecnología de partículas de sílice híbrida BEH C18 proporciona una estabilidad de temperatura y pH líder en el sector, con una resolución y una vida útil de la columna excepcionales.
  • La tecnología de superficies de alto rendimiento (HPS) MaxPeak Premier (disponible en columnas de 10 mm de diámetro interno) proporciona una opción adicional para reducir la adsorción no específica y obtener la máxima sensibilidad, reproducibilidad y productividad.
  • Una gama de patrones analíticos de alta calidad con trazabilidad de lotes facilita las pruebas de idoneidad del sistema, el desarrollo de métodos y la resolución de problemas.


Empaquetado con óptima densidad del lecho

Empaquetado con óptima densidad del lecho

Para columnas de preparación con relaciones de aspecto más pequeñas, el empaquetado de la pasta a alta presión con partículas pequeñas a menudo no logra la densidad de lecho deseada que se encuentra en columnas analíticas bien diseñadas. Una compresión axial excesiva en la entrada puede provocar la rotura de partícula, la formación de canales y una permeabilidad reducida del lecho. Las columnas OBD cuidadosamente diseñadas ofrecen ventajas significativas, como una mayor vida útil de la columna, mayor eficacia, mejor forma de los picos y menor contrapresión.

Superficies de alto rendimiento MaxPeak con columnas de diámetro interno de 10 mm

Superficies de alto rendimiento MaxPeak con columnas de diámetro interno de 10 mm

Los ácidos nucleicos, incluidos los oligonucleótidos, son polianiónicos (carga negativa) y, como tal, se adsorben fácilmente en las superficies de óxidos metálicos de las columnas de acero inoxidable. Las columnas OBD BEH C18 para oligonucleótidos XBridge Premier de Waters están fabricadas con componentes de hardware modificados para tener una química de superficie híbrida inerte orgánica/inorgánica basada en sílice que reduce en gran medida la adsorción no específica (NSA) de ácidos nucleicos, lo que permite una mejor recuperación y reproducibilidad para ciertos compuestos que deben aislarse de un principio activo para su posterior estudio. Las columnas OBD BEH C18 para oligonucleótidos XBridge Premier también eliminan la necesidad de pasivación de la columna/acondicionamiento de la muestra, por lo que se pueden iniciar los procesos de recolección de fracciones sin demora. 

Columnas para oligonucleótidos BEH C18 seleccionadas y analizadas por lotes de 130 y 300 Å, partículas de 2,5 y 5 µm

Columnas para oligonucleótidos BEH C18 seleccionadas y analizadas por lotes de 130 y 300 Å, partículas de 2,5 y 5 µm

La tecnología de partículas híbridas con puentes de etileno (BEH) certificada por lotes de Waters para oligonucleótidos garantiza un mayor rendimiento, reproducibilidad y escalado para la purificación. Las altas temperatura y el pH elevado son estrategias frecuentes para minimizar las interacciones secundarias en la separación y purificación de oligonucleótidos. La tecnología de partículas BEH resiste las condiciones más duras, como pH y temperatura elevados, y los aditivos que normalmente se requieren para el análisis de oligonucleótidos.

Las columnas de preparación OBD para oligonucleótidos XBridge, probadas por lotes y con certificación de control de calidad, proporcionan una garantía adicional para la reproducibilidad y la transferencia de métodos, y asisten a las necesidades de purificación emergentes para siRNA, ASO y reactivos de oligonucleótidos estándar y nuevos químicamente diversos. Cada lote de sorbente BEH C18 de oligonucleótidos se somete a pruebas de control de calidad y se selecciona utilizando el patrón de oligonucleótidos MassPrep de Waters y una evaluación rigurosa de la resolución y de la asimetría de los picos a partir de una separación IP-RP con acetato de trietilamonio. Estos sorbentes cuidadosamente examinados están disponibles en tamaños de partícula de 2,5 y 5 µm, así como en tamaños de poro de 130 y 300 Å, para proporcionar a los químicos de oligonucleótidos una gama de opciones versátiles para purificar una variedad de diferentes productos de síntesis.

Excepcional duración de las columnas

Excepcional duración de las columnas

Las columnas de preparación OBD para oligonucleótidos XBridge y XBridge Premier de Waters se rellenan con partículas de sílice híbridas con puentes de etileno (BEH) C18 de Waters y muestran una notable longevidad de la columna en condiciones de pH y temperatura elevados, a la vez que mantienen un rendimiento de separación excepcional. Con los cuidados adecuados, se sabe que las columnas BEH C18 para oligonucleótidos superan las 10 000 inyecciones sin pérdida de eficacia ni retención. 

Capacidad de carga predecible

Capacidad de carga predecible

En las purificaciones de preparación, varios parámetros influyen en la capacidad de carga. La eficacia de columna, el tamaño de poro, el tamaño de partícula y los parámetros del método desempeñan un papel importante. Las columnas con mayor tamaño de poro permiten una mejor transferencia de masa y unos picos más definidos de los analitos más grandes. Debido a su área superficial reducida, pueden presentar una menor capacidad de carga. Las columnas de preparación OBD para oligonucleótidos XBridge de Waters están disponibles con diferentes tamaños de poro y una amplia gama de diámetros internos de columna para lograr una escalabilidad predecible y una capacidad de carga mejorada.

Fracciones de alta pureza y mayores rendimientos

Fracciones de alta pureza y mayores rendimientos

La purificación de oligonucleótidos de alta pureza y calidad es fundamental para minimizar los problemas de seguridad y eficacia relacionados con las impurezas no deseadas en los estudios toxicológicos. Las columnas de preparación OBD para oligonucleótidos XBridge de 2,5 µm de alta eficacia facilitan el aislamiento de las impurezas tempranas y de coelución, al mismo tiempo que mantienen el perfil cromatográfico sin comprometer la alta recuperación.


“Las columnas OBD BEH 300 Å C18 de 5 µm para oligonucleótidos XBridge de Waters han mostrado una mejora definitiva en la eliminación de las primeras impurezas de elución”.

— Amy Howie, directora de Calidad y Cumplimiento de Productos, Oligo Factory, Inc.

— Amy Howie, directora de Calidad y Cumplimiento de Productos, Oligo Factory, Inc.

Oligo Factory es una CMO líder que se especializa en oligonucleótidos personalizados para el descubrimiento de última etapa, fases clínicas, diagnóstico y RUO, con la misión de proporcionar oligonucleótidos rentables y de alta calidad, al tiempo que proporciona un servicio flexible e individualizado para cada cliente.Están trabajando con Waters Corporation para optimizar la purificación de moléculas de sgRNA críticas para la investigación y el uso clínico de la edición genética CRISPR. 


Espiral de la molécula de ADN

Soluciones


Estabilidad de partículas con protección MaxPeak HPS

Estabilidad de partículas con protección MaxPeak HPS

Los grupos fosfodiéster de los oligonucleótidos pueden adsorber los metales utilizados en la construcción de columnas estándar. El uso de componentes de hardware de columna de baja adsorción puede mejorar la forma de los picos al minimizar la quelación, lo que da lugar a una retención más fiable y a parámetros cromatográficos más coherentes. Las columnas de preparación de 5 µm OBD BEH C18 para oligonucleótidos XBridge Premier de 130 Å y 300 Å, que se fabrican con componentes depositados en fase de vapor MaxPeak HPS para mejorar la forma de los picos y mejorar la recuperación, están disponibles en 10 mm de diámetro interno y en longitudes de 50, 100 y 150 mm.

  • Reversed-Phase Analysis
  • Oligonucleotides
  • Purification

Estabilidad de partículas y rendimiento para el desarrollo de métodos

Estabilidad de partículas y rendimiento para el desarrollo de métodos

Las columnas de preparación OBD para oligonucleótidos XBridge probadas por lotes y con certificado de QC están disponibles en una amplia gama de diámetros y longitudes múltiples para opciones de purificación a escala de laboratorio que son predecibles y flexibles para el escalado vertical directo. Los tamaños incluyen:

  • Reversed-Phase Analysis
  • Oligonucleotides
  • Purification

Formulaciones de oligonucleótidos y ácidos nucleicos de alta pureza para la evaluación comparativa del rendimiento.

Formulaciones de oligonucleótidos y ácidos nucleicos de alta pureza para la evaluación comparativa del rendimiento.

Patrones de oligonucleótidos/ácidos nucleicos para la evaluación comparativa del rendimiento

Patrones de oligonucleótidos/ácidos nucleicos para la evaluación comparativa del rendimiento

Como complemento de nuestras columnas de fase reversa para oligonucleótidos, Waters proporciona una gama de patrones analíticos de alta calidad con trazabilidad de lotes para facilitar las pruebas de idoneidad del sistema, el desarrollo de métodos y la resolución de problemas. Estos incluyen el patrón de oligonucleótidos MassPREP de Waters que contiene una secuencia de oligodT de 15-35 mer que se utiliza para verificar el control de calidad (QC) de todas las columnas de oligonucleótidos de marca de Waters, un patrón de ssDNA de 20 mer para la evaluación comparativa de la fragmentación LC-MS/MS y el análisis de secuencias, un oligonucleótido antisentido (ASO) muy modificado y conjugado con lípidos, secuencias ssDNA y dsDNA, y más.

  • Reversed-Phase Analysis
  • Oligonucleotides
  • Purification

Proteger y prolongar la vida útil de la columna analítica.

Proteger y prolongar la vida útil de la columna analítica.

Precolumna preparativa para prolongar la vida útil de las columnas

Precolumna preparativa para prolongar la vida útil de las columnas

Las columnas de preparación OBD BEH C18 para oligonucleótidos XBridge están disponibles con precolumna. Los cartuchos de columna están rellenos con el mismo sorbente y se pueden utilizar para evitar la contaminación y la suciedad en las columnas de preparación, lo que prolonga la vida útil de la columna. Colocar este conjunto de protección delante de la columna preparativa prolongará la vida útil de la columna y reducirá los costes de purificación.

  • Reversed-Phase Analysis
  • Oligonucleotides
  • Purification

Aplicaciones

Los grupos fosfodiéster de los oligonucleótidos pueden adsorber los metales que se encuentran en el cuerpo de la columna y en las fritas. Al utilizar el hardware de columnas de superficie de alto rendimiento MaxPeak de baja adsorción, se puede mejorar la forma de los picos al minimizar la quelación, lo que da lugar a una retención más fiable y a parámetros cromatográficos más coherentes. Las columnas de preparación para oligonucleótidos BEH C18 XBridge Premier se fabrican con componentes depositados en fase de vapor MaxPeak HPS para mejorar la forma de los picos y mejorar la recuperación.

Los grupos fosfodiéster de los oligonucleótidos pueden adsorber los metales que se encuentran en el cuerpo de la columna y en las fritas. Al utilizar el hardware de columnas de superficie de alto rendimiento MaxPeak de baja adsorción, se puede mejorar la forma de los picos al minimizar la quelación, lo que da lugar a una retención más fiable y a parámetros cromatográficos más coherentes. Las columnas de preparación para oligonucleótidos BEH C18 XBridge Premier se fabrican con componentes depositados en fase de vapor MaxPeak HPS para mejorar la forma de los picos y mejorar la recuperación.


Notas de aplicación

Notas de aplicación

Un desafío con la purificación de oligonucleótidos a escala de laboratorio es el aislamiento de impurezas que pueden ser similares a las moléculas objetivo. Las partículas pequeñas no suelen ser frecuentes para la purificación a escala de laboratorio debido a la alta presión que pueden generar. Las columnas de preparación de 2,5 µm OBD BEH C18 para oligonucleótidos XBridge probadas por lotes de Waters proporcionan un nuevo nivel de garantía para el aislamiento eficiente y a baja presión de sgRNA CRISPR complejos, siRNA y conjugados de oligonucleótidos. Los parámetros de purificación optimizados con el modo de gradiente enfocado y la fase móvil sin HFIP permiten una purificación muy eficiente, de alto rendimiento, sin riesgos y rentable.

Un desafío con la purificación de oligonucleótidos a escala de laboratorio es el aislamiento de impurezas que pueden ser similares a las moléculas objetivo. Las partículas pequeñas no suelen ser frecuentes para la purificación a escala de laboratorio debido a la alta presión que pueden generar. Las columnas de preparación de 2,5 µm OBD BEH C18 para oligonucleótidos XBridge probadas por lotes de Waters proporcionan un nuevo nivel de garantía para el aislamiento eficiente y a baja presión de sgRNA CRISPR complejos, siRNA y conjugados de oligonucleótidos. Los parámetros de purificación optimizados con el modo de gradiente enfocado y la fase móvil sin HFIP permiten una purificación muy eficiente, de alto rendimiento, sin riesgos y rentable.


Notas de aplicación

Notas de aplicación

La tecnología CRISPR desempeña un papel fundamental en la modificación de la edición genética. La tecnología utiliza ARN de guía único (sgRNA), de ahí la importancia de la pureza del sgRNA para mejorar la exactitud y la precisión terapéuticas. Las columnas de HPLC tradicionales de 8 a 20 µm disponibles en el mercado pueden no satisfacer las necesidades de seguridad y exactitud de los fármacos debido a la falta del poder de resolución necesario para aislar las impurezas de las secuencias objetivo. 

La nueva columna de 5 µm BEH C18 para oligonucleótidos XBridge, 300 Å, probada por lotes, mejora la eficacia de la separación y el mecanismo de retención para ácidos nucleicos más grandes, como el sgRNA y las aplicaciones relacionadas. Los tamaños de partícula más pequeños y las dimensiones optimizadas de los poros con 300 Å se aplican para lograr nuevos niveles de pureza en un solo paso, necesarios para las aplicaciones CRISPR de alta precisión.

La tecnología CRISPR desempeña un papel fundamental en la modificación de la edición genética. La tecnología utiliza ARN de guía único (sgRNA), de ahí la importancia de la pureza del sgRNA para mejorar la exactitud y la precisión terapéuticas. Las columnas de HPLC tradicionales de 8 a 20 µm disponibles en el mercado pueden no satisfacer las necesidades de seguridad y exactitud de los fármacos debido a la falta del poder de resolución necesario para aislar las impurezas de las secuencias objetivo. 

La nueva columna de 5 µm BEH C18 para oligonucleótidos XBridge, 300 Å, probada por lotes, mejora la eficacia de la separación y el mecanismo de retención para ácidos nucleicos más grandes, como el sgRNA y las aplicaciones relacionadas. Los tamaños de partícula más pequeños y las dimensiones optimizadas de los poros con 300 Å se aplican para lograr nuevos niveles de pureza en un solo paso, necesarios para las aplicaciones CRISPR de alta precisión.



Notas de aplicación

Notas de aplicación


Los datos hablan por sí solos

Los datos hablan por sí solos
Determinaciones de la pureza en fracciones para un análisis de purificación de 25 mg utilizando una nueva columna preparativa de 2,5 µm BEH C18 para oligonucleótidos XBridge de 130 Å.
(A) Comparación de los cromatogramas obtenidos para fosfato de hidrocortisona utilizando columnas MaxPeak Premier (trazado negro) y estándar (trazado gris) ACQUITY UPLC BEH C18, 130 Å; 1,7 µm; 2,1 x 50 mm. La carga de masa era de 2 ng. Las separaciones en gradiente de acetonitrilo se llevaron a cabo con una fase móvil acuosa de formiato de amonio 10 mM (pH 3,0), un flujo de 0,5 mL/min y una temperatura de 30 °C. Los picos se detectaron utilizando un detector PDA, con el canal de 246 nm mostrado. (B) Gráfico log-log del área de los picos frente a la carga de masa para el fosfato de hidrocortisona separado mediante columnas MaxPeak Premier (símbolos negros) y estándar (símbolos grises), con una carga de masa de 2-200 ng.

Recursos


  • Nota técnica

Columnas de HPLC de baja adsorción basadas en superficies de alto rendimiento MaxPeak

Columnas de HPLC de baja adsorción basadas en superficies de alto rendimiento MaxPeak

Relacionado

Consiga separaciones rápidas y eficientes a escala de laboratorio para obtener un mayor rendimiento con las columnas HPLC preparativas de Waters con el fin de obtener un rendimiento predecible y un fácil escalado de escala analítica a preparativa.

Los flujos de trabajo analíticos robustos y prácticos de Waters para la caracterización y la monitorización de oligonucleótidos sintéticos garantizan la comprensión del proceso y la calidad del producto.

Desarrolle y cualifique métodos con confianza con los patrones personalizados de oligonucleótidos y ácidos nucleicos para análisis de LC y LC-MS.

Analice productos de terapia génica para obtener información sobre la potencia y la seguridad de la muestra con las columnas para cromatografía de exclusión por tamaño (SEC) con terapia génica (GTx) de Waters, diseñadas para proporcionar datos exactos de alto rendimiento.

Más información sobre las soluciones de consumibles y las columnas de purificación de oligonucleótidos.

Más información sobre las soluciones de consumibles y las columnas de purificación de oligonucleótidos.

Los flujos de trabajo analíticos robustos y prácticos de Waters para la caracterización y la monitorización de oligonucleótidos sintéticos garantizan la comprensión del proceso y la calidad del producto.
Volver arriba Volver arriba