El resurgimiento en el desarrollo de productos terapéuticos con oligonucleótidos ha dado lugar a la creación de proyectos en desarrollo en toda la industria. Al trabajar a nivel de transcripción y traducción de genes, estos fármacos de ácidos nucleicos cortos son muy prometedores para muchos trastornos hereditarios y dolencias comunes por igual.
Las herramientas y técnicas de LC-MS de Waters desempeñan un papel de vital importancia en la confirmación de la identidad y la pureza de estos fármacos, así como en la cuantificación de su presencia en los biofluidos.
Caso práctico: BioSpring implementa flujos de trabajo LC-MS de Waters para oligonucleótidos para ampliar la cartera existente
Los sistemas y columnas MaxPeak Premier eliminan la imprevisibilidad de las pérdidas de analitos debidas a interacciones con metales, que pueden ser especialmente pronunciadas con los oligonucleótidos cargados negativamente.
Simplifique los análisis biofarmacéuticos de LC-MS de alto rendimiento para todos los usuarios con el sistema LC-MS BioAccord de Waters con ACQUITY Premier, una plataforma integrada preparada para el cumplimiento normativo que se puede implementar desde los laboratorios de descubrimiento hasta GxP.
Acelere la caracterización de oligonucleótidos sintéticos con el sistema de sobremesa HRMS de alto rendimiento Xevo G3 QTof, que proporciona resultados cualitativos y cuantitativos exactos.
Amplíe el alcance del análisis de sensibilidad más avanzado con el espectrómetro de masas de triple cuadrupolo Xevo TQ Absolute de Waters, que ofrece niveles sin precedentes de fiabilidad, reproducibilidad y rendimiento para las aplicaciones de oligonucleótidos.
Evalúe el carácter inerte del sistema ACQUITY Premier UPLC y la columna ACQUITY Premier OST utilizando el oligómero de 21 nt: Comparación del cromatograma UV de la concentración más baja detectable (0,5 nM o 5 femtomoles del oligonucleótido de 21 iones cargado en la columna) con la anterior inyección de blanco.
Curvas de calibración de GEM91 utilizando una columna de acero inoxidable y un sistema convencional (rojo), una columna ACQUITY Premier y un sistema convencional (azul) y una columna y sistema ACQUITY Premier (violeta). Las diferentes pendientes indican diferencias claras en la recuperación utilizando las columnas y los sistemas probados.
Cromatogramas TUV y TIC que muestran el rendimiento del sistema BioAccord cuando el patrón OST 1 μM se diluyó 100 veces (carga de muestra de 100 fmoles). Los cinco oligonucleótidos principales se detectan claramente en los cromatogramas de UV y TIC, lo que indica que el sistema de LC-MS y el método tienen la sensibilidad adecuada para detectar impurezas de oligonucleótidos de bajo nivel.
Se logró la confirmación de la secuencia en escalera completa de MS/MS para la secuencia de ssRNA de 5'-UCGUCAAGCGAUUACAAGGTT-3'. El experimento se llevó a cabo utilizando el pico M4- como ion precursor. Las asignaciones de los picos de fragmentación se han realizado comparándolas con las masas teóricas mediante cálculos sencillos en archivos de Excel. MaxEnt3 se utilizó para la deconvolución y la eliminación de isótopos de la carga.
