Purificar um produto de oligonucleotídeo de comprimento completo das impurezas geradas durante a síntese é essencial para garantir sua funcionalidade, segurança e eficácia em aplicações farmacêuticas e de diagnóstico. Devido à sua natureza polianiônica, a purificação de oligonucleotídeos com alta seletividade e resolução é um desafio. A cromatografia de fase reversa com pareamento iônico (IP-RP, Ion-Pairing Reversed-Phase) surgiu como a técnica dominante e preferida.
Colunas estáveis de alto pH/temperatura e testadas em lote com níveis controlados de interações secundárias ajudam a remover rapidamente os gargalos que consomem tempo. As colunas de OBD Waters XBridge BEH C18 para oligonucleotídeos são a escolha certa para colunas preparativas, oferecendo desempenho garantido, escalabilidade consistente e purificação de alta recuperação de vários oligonucleotídeos com modificações químicas complexas.
Para colunas preparativas com proporções de medidas menores, o preenchimento de pasta de alta pressão com partículas pequenas muitas vezes não consegue atingir a densidade de leito desejada encontrada em colunas analíticas bem projetadas. A compressão axial excessiva na entrada pode resultar em quebra de partículas, canalização e redução da permeabilidade do leito. As colunas de OBD projetadas cuidadosamente oferecem benefícios significativos, incluindo maior vida útil da coluna, maior eficiência, melhor formato de pico e menor contrapressão.
Os ácidos nucleicos, incluindo os oligonucleotídeos, são polianiônicos (carregados negativamente) e, dessa forma, prontamente adsorvem superfícies de óxido metálico em colunas de aço inoxidável. As colunas de OBD Waters XBridge Premier BEH C18 para oligonucleotídeos são construídas com componentes de hardware modificados para ter uma química de superfície inerte híbrida orgânica/inorgânica à base de sílica que reduz consideravelmente a adsorção não específica (NSA, Non-Specific Adsorption) de ácidos nucleicos, permitindo assim uma recuperação aprimorada e uma reprodutibilidade melhorada para determinados compostos que precisam ser isolados de uma substância medicamentosa para estudos posteriores. As colunas de OBD XBridge Premier BEH C18 para oligonucleotídeos também eliminam a necessidade de passivação da coluna/condicionamento da amostra para que seja possível iniciar as corridas de coleta de frações sem demora.
A tecnologia híbrida de pontes de etileno (BEH, Ethylene Bridge Hybrid) certificada em lote da Waters para oligonucleotídeos garante desempenho, reprodutibilidade e aumento de escala adicionais para purificação. Alta temperatura e alto pH são estratégias predominantes para minimizar as interações secundárias na separação e purificação de oligonucleotídeos. A tecnologia de partículas BEH suporta condições adversas como alto nível de pH, temperatura e aditivos que normalmente são necessários para a análise de oligonucleotídeos.
As colunas preparativas de OBD XBridge para oligonucleotídeos, testadas em lote e certificadas por controle de qualidade, fornecem uma garantia extra de reprodutibilidade e transferência de métodos, além de atender às necessidades crescentes de purificação para siRNAs (RNAs de interferência pequena), ASOs (Oligonucleotídeos antissentido) e reagentes de oligonucleotídeos padrão e novos quimicamente diversos. Cada lote de sorvente BEH C18 para oligonucleotídeos é testado por controle de qualidade e selecionado utilizando o Padrão Waters MassPrep para oligonucleotídeos e uma avaliação rigorosa de resolução e cauda de pico a partir de uma separação de acetato de trietilamônio por IP-RP (Fase reversa - pareamento iônico). Esses sorventes cuidadosamente examinados estão disponíveis em tamanhos de partícula de 2,5 e 5 µm, bem como em tamanhos de poro de 130 e 300 Å, para fornecer aos químicos de oligonucleotídeos uma variedade de opções versáteis para purificar diversos produtos de síntese.
As Colunas preparativas de OBD XBridge e XBridge Premier para oligonucleotídeos são preenchidas com partículas BEH (híbridas com pontes de etileno) de sílica C18 da Waters e demonstram uma longevidade notável da coluna sob condições de pH e temperatura elevados, mantendo um desempenho inigualável nas separações. Com cuidado, as colunas BEH C18 para oligonucleotídeos podem exceder 10000 injeções sem perda de eficiência ou retenção.
Em purificações preparativas, a capacidade de carregamento é influenciada por vários parâmetros. A eficiência da coluna, o tamanho de poro, o tamanho da partícula e os parâmetros do método desempenham papéis importantes. Colunas com poros mais largos permitem melhor transferência de massa e formatos de pico mais nítidos de analitos maiores. Com sua área de superfície reduzida, elas podem apresentar menor capacidade de carregamento. As colunas preparativas de OBD Waters XBridge para oligonucleotídeos estão disponíveis em diferentes tamanhos de poros e em uma ampla variedade de diâmetros internos de coluna para escalabilidade previsível e capacidade de carregamento aprimorada.
A purificação de oligonucleotídeos de alta pureza e qualidade é fundamental para minimizar as preocupações com a segurança e a eficácia relacionadas a impurezas indesejadas em estudos toxicológicos. As colunas preparativas de OBD XBridge de 2,5 µm para oligonucleotídeos de alta eficiência facilitam o isolamento de impurezas iniciais e coeluentes, mantendo o perfil cromatográfico sem comprometer a alta recuperação.
Complementando nossas colunas de fase reversa para oligonucleotídeos, a Waters fornece uma variedade de padrões analíticos de alta qualidade e rastreáveis por lote para facilitar o teste de adequação do sistema, o desenvolvimento de métodos e a solução de problemas. Isso inclui o Padrão MassPREP para oligonucleotídeos, que contém uma escada de oligodT de 15 a 35 mer para verificar o controle de qualidade de todas as colunas para oligonucleotídeos da Waters, um padrão de ssDNA de 20 mer para comparação de fragmentação de LC– MS/MS e análise de sequência, um oligonucleotídeo antissentido conjugado com lipídio (ASO) fortemente modificado, escadas de ssDNA e dsDNA e muito mais.
As colunas preparativas de OBD XBridge BEH C18 para oligonucleotídeos estão disponíveis com pré-colunas. Os cartuchos da coluna são preenchidos com o mesmo sorvente e podem ser utilizados para evitar a contaminação e a incrustação das colunas preparativas, resultando em uma vida útil mais longa da coluna. Colocar essa unidade de pré-coluna na frente da coluna preparativa proporcionará uma vida útil mais longa da coluna e reduzirá os custos de purificação.
A tecnologia CRISPR desempenha um papel fundamental na modificação da edição genética. A tecnologia utiliza um RNA de guia único (sgRNA), daí a importância da pureza do sgRNA para melhorar a exatidão e a precisão terapêutica. As colunas tradicionais de HPLC de 8 a 20 µm disponíveis no mercado podem não atender à necessidade de segurança e exatidão de medicamentos devido à falta de poder de resolução necessário para isolar as impurezas das sequências de destino.
A nova coluna XBridge BEH C18 de 300 Å e 5 µm para oligonucleotídeos testada em lote melhora a eficiência da separação e o mecanismo de retenção para ácidos nucleicos maiores, como sgRNA e aplicações relacionadas. Os tamanhos menores de partículas e as dimensões otimizadas dos poros com 300 Å são aplicados para atingir novos níveis de pureza de passagem única, necessários para aplicações de CRISPR de alta precisão.
A tecnologia CRISPR desempenha um papel fundamental na modificação da edição genética. A tecnologia utiliza um RNA de guia único (sgRNA), daí a importância da pureza do sgRNA para melhorar a exatidão e a precisão terapêutica. As colunas tradicionais de HPLC de 8 a 20 µm disponíveis no mercado podem não atender à necessidade de segurança e exatidão de medicamentos devido à falta de poder de resolução necessário para isolar as impurezas das sequências de destino.
A nova coluna XBridge BEH C18 de 300 Å e 5 µm para oligonucleotídeos testada em lote melhora a eficiência da separação e o mecanismo de retenção para ácidos nucleicos maiores, como sgRNA e aplicações relacionadas. Os tamanhos menores de partículas e as dimensões otimizadas dos poros com 300 Å são aplicados para atingir novos níveis de pureza de passagem única, necessários para aplicações de CRISPR de alta precisão.